Tổng số bệnh viện được Sở Y tế TP.HCM đánh giá là 110 bệnh viện, bao gồm 32 bệnh viện thành phố; 23 bệnh viện quận, huyện; 53 bệnh viện tư nhân và 2 bệnh viện bộ ngành (Bệnh viện Chỉnh hình và Phục hồi Chức năng TP.HCM và Bệnh viện Đa khoa Bưu điện).
Trong đó, có 7 bệnh viện tại TP.HCM được đánh giá có chất lượng tốt nhất năm 2019 gồm: Bệnh viện Nhân dân 115 (50/78), Bệnh viện Hoàn Mỹ Sài Gòn (48/82), Bệnh viện Từ Dũ (48/82), Bệnh viện Hùng Vương (47/82), Bệnh viện Đa khoa Quốc tế Vinmec TP.HCM (47/82), Bệnh viện Nhân dân Gia định (47/83), Bệnh viện Nhi đồng 1 (42/82), Viện Y Dược học Dân tộc (41/79).
Ngoài ra, Sở Y tế TP.HCM cũng công bố chất lượng 2 bệnh viện trực thuộc bộ ngành. Cả 2 bệnh viện này có điểm chất lượng không cao. Cụ thể, Bệnh viện Bưu Điện (tiền thân là Bệnh xá ngành bưu điện) 3.40 điểm và Bệnh viện Chỉnh hình và Phục hồi chức năng TP.HCM (thuộc Bộ Lao động - Thương binh và Xã hội) 2.67 điểm.
Theo Sở Y tế, năm 2019 các bệnh viện đã có nhiều nỗ lực, phấn đấu cải tiến chất lượng. Tuy nhiên, kết quả "chấm điểm" còn lộ ra nhiều hạn chế như hoạt động cải tiến chất lượng của nhiều bệnh viện vẫn chưa đi vào chiều sâu, đặc biệt là các hoạt động giám sát.
Một số bệnh viện ngoài công lập chưa chú trọng đến công tác quản trị bệnh viện, do thiếu nhân lực quản lý chuyên trách, các vị trí lãnh đạo phòng chức năng thường kiêm nhiệm, chưa chú ý đến việc phát triển chuyên môn kỹ thuật, nghiên cứu khoa học; hoạt động dinh dưỡng cũng chưa được đầu tư và quan tâm đúng mức. Các tồn tại này thường tập trung vào một số bệnh viện đa khoa, bệnh viện chuyên khoa mắt và chuyên khoa thẩm mỹ tư nhân và 1 bệnh viện công lập (Bệnh viện quận 3).