Để bảo tồn và phát huy tốt giá trị lịch sử, tiến hành lập phương án thiết kế quy hoạch tổng thể khu di tích hài hòa về không gian và kiến trúc cảnh quan, UBND TP.HCM đề nghị Bộ Quốc phòng bàn giao khu đất và các tài sản gắn liền với di tích cho TP quản lý và đầu tư dự án tu bổ, tôn tạo di tích.
Việc này thực hiện theo nội dung đã được thống nhất giữa Ban Thường vụ Quân ủy trung ương và Ban Thường vụ Thành ủy TP.HCM.
Ba Son là khu đất di tích lịch sử quốc gia và là địa điểm lưu niệm Chủ tịch Tôn Đức Thắng. Khu lưu niệm Chủ tịch Tôn Đức Thắng thuộc khu đất văn hóa bảo tồn, phương án bảo tồn đã được Bộ Văn hóa - thể thao du lịch thống nhất vào năm 2015.
Hiện tại khu đất này đang được Tổng công ty Ba Son quản lý và đã được UBND TP.HCM cấp giấy chứng nhận quyền sử dụng đất (đất quốc phòng).
Khu vực Ba Son gồm ụ tàu nhỏ, phường Bến Nghé, quận 1. Khu bảo vệ di tích gồm hai khu vực với tổng diện tích hơn 6.000m2.
Được biết, theo quy hoạch phát triển giao thông vận tải TP.HCM đến năm 2020 và tầm nhìn sau năm 2020 đã được Thủ tướng phê duyệt, tuyến đường sắt đô thị số 1 (Bến Thành - Suối Tiên) có hướng tuyến đi ngang khu vực này.
Công trình cũng được yêu cầu bố trí hệ thống kỹ thuật và thi công đặc thù, phương án xử lý về mặt bằng không gian kiến trúc cảnh quan nhằm hạn chế phát sinh các tác động tiêu cực đến khu di tích.