Từ đầu dịch đến nay, chỉ ba viện gồm Vệ sinh Dịch tễ Trung ương, Viện Pasteur TP HCM, Viện Pasteur Nha Trang, được phép xét nghiệm khẳng định các mẫu bệnh là dương tính. Các cơ sở khác chỉ xét nghiệm sàng lọc, khi có kết quả dương tính phải chuyển mẫu đến một trong ba viện xét nghiệm lại để khẳng định.
Để đẩy nhanh tốc độ có kết quả xét nghiệm mẫu bệnh phẩm, từ ngày 21/3 Bộ Y tế cho phép cả 22 cơ sở được xét nghiệm khẳng định nCoV.
Các kỹ thuật mà 22 cơ sở này có thể thực hiện gồm: xét nghiệm sinh học phân tử (Realtime RT-PCR) để phát hiện ARN của virus corona trong bệnh phẩm đường hô hấp; xét nghiệm nhanh đối với bệnh phẩm đường hô hấp, máu; xét nghiệm miễn dịch học (ELISA) đối với bệnh phẩm đường hô hấp, máu.
Trường hợp kết quả xét nghiệm dương tính, cơ sở xét nghiệm thông báo kết quả cho ban chỉ đạo địa phương và báo cáo Ban chỉ đạo Quốc gia.
Trường hợp kết quả xét nghiệm âm tính, cơ sở xét nghiệm thông báo kết quả xét nghiệm cho đơn vị gửi mẫu.
Các phòng xét nghiệm phải tuân thủ quy trình, phương pháp xét nghiệm theo hướng dẫn của nhà sản xuất sinh phẩm chẩn đoán, đảm bảo chất lượng xét nghiệm và an toàn sinh học.